Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tspan4Q9DCK3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms