Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SelenooQ9DBC0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SelenooQ9DBC0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms