Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c6Q9D8P7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms