Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Echdc3Q9D7J9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms