Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns2Q9D7J7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns2Q9D7J7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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