Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc9bQ9D6E4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc9bQ9D6E4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms