Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ribc2Q9D4Q1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ribc2Q9D4Q1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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