Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef12Q9D2F1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms