Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Chordc1Q9D1P4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms