Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Thumpd2Q9CZB3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms