Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube2fQ9CY34 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ube2fQ9CY34 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ube2fQ9CY34 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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