Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Bud23Q9CY21 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Bud23Q9CY21 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Bud23Q9CY21 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Bud23Q9CY21 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Bud23Q9CY21 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Bud23Q9CY21 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Bud23Q9CY21 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Bud23Q9CY21 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Bud23Q9CY21 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Bud23Q9CY21 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Bud23Q9CY21 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Bud23Q9CY21 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Bud23Q9CY21 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Bud23Q9CY21 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Bud23Q9CY21 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Bud23Q9CY21 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Bud23Q9CY21 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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