Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pfdn1Q9CWM4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pfdn1Q9CWM4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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