Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Chchd1Q9CQA6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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