Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Commd4Q9CQ02 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms