Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lrrc4Q99PH1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms