Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smim3Q99PE5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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