Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcf2Q99LE6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms