Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hps4Q99KG7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hps4Q99KG7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms