Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tmed9Q99KF1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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