Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Afg3l1Q920A7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Afg3l1Q920A7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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