Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cabp4Q8VHC5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms