Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Uhrf1Q8VDF2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Uhrf1Q8VDF2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms