Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vmn1r200Q8R281 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vmn1r200Q8R281 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Vmn1r200Q8R281 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vmn1r200Q8R281 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vmn1r200Q8R281 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vmn1r200Q8R281 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vmn1r200Q8R281 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vmn1r200Q8R281 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Vmn1r200Q8R281 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
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Vmn1r200Q8R281 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Vmn1r200Q8R281 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Vmn1r200Q8R281 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Vmn1r200Q8R281 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Vmn1r200Q8R281 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Vmn1r200Q8R281 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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