Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sde2Q8K1J5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sde2Q8K1J5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms