Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Cldn34c1Q8K193 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Cldn34c1Q8K193 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Cldn34c1Q8K193 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Cldn34c1Q8K193 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn34c1Q8K193 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms