Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Csnka2ipQ8CH19 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Csnka2ipQ8CH19 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Csnka2ipQ8CH19 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Csnka2ipQ8CH19 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnka2ipQ8CH19 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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