Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc17Q8CE13 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms