Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin52Q8CD94 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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