Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Aph1bQ8C7N7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Aph1bQ8C7N7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Aph1bQ8C7N7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Aph1bQ8C7N7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aph1bQ8C7N7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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