Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem260Q8BMD6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem260Q8BMD6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms