Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gpc2Q8BKV1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpc2Q8BKV1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms