Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy1Q8BIJ7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms