Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra5Q8BHJ7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms