Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc5a7Q8BGY9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a7Q8BGY9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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