Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smndc1Q8BGT7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smndc1Q8BGT7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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