Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD7

Npas4, Neuronal PAS domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas4Q8BGD7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Npas4Q8BGD7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas4Q8BGD7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms