Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Polr2eQ80UW8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms