Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Dsg1bQ7TSF1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms