Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zfp397Q7TNK4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms