Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nudcd1Q6PIP5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nudcd1Q6PIP5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms