Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CtifQ6PEE2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CtifQ6PEE2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms