Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrlQ6PE55 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrlQ6PE55 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms