Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gga2Q6P5E6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms