Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg16l2Q6KAU8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms