Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3rf1Q69ZI1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Sh3rf1Q69ZI1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3rf1Q69ZI1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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