Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Cntn4Q69Z26 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cntn4Q69Z26 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.2 ms