Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcncQ62447 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcncQ62447 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcncQ62447 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms