Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Sh3gl2Q62420 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Sh3gl2Q62420 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Sh3gl2Q62420 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Sh3gl2Q62420 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Sh3gl2Q62420 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Sh3gl2Q62420 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Sh3gl2Q62420 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Sh3gl2Q62420 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Sh3gl2Q62420 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Sh3gl2Q62420 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sh3gl2Q62420 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms