Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga6Q61739 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms